Promoter (biológia)

Promoter - egy szabályozó DNS-régió előtt található (felé 5 „vége a molekula) nyitott leolvasási keretet a gén vagy operon elején, ellenőrzésének biztosítása, a gén transzkripcióját vagy operon. Minden egyes gén vagy operon lehet több, mint egy promoter, szabályozott egymástól elkülönítve, és ezen túlmenően, más szabályozó régiók. A promoter szükséges átírása.

prokarióták

Szerkezete egy bakteriális promoter

Tipikus bakteriális promoter tartalmaz egy szekvenciát, 2:

• pozícióban 10 (tíz nukleotidot a startkodont ATG) - szekvenciát TATAAT (Pribnou doboz)
• pozícióban -35 - szekvenciát TTGATSA

Ezeket a szekvenciákat a konzervált, de különböző nukleotidból változhat a különböző fajok és a gének. Továbbá, az ilyen elemeket ismerik csak Sigma alegysége RNS-polimeráz, egy 70 kDa-os izoforma más felismerni más szekvenciákkal.

A többi szabályozó szekvencia lehet a promoterszekvencia közelében lévő: az üzemeltetők, cisz-elemeket. Gének baktériumokban gyakran kombinálják operon - csoport kódoló gének egy adott biokémiai útvonal együttesen szabályozzák és közel egymáshoz a kromoszómán. Operon egy vagy több promoter. A laktáz operon, amelyet először leírt, csak egy promotert, ahol a gén átíródik három.

megindítását transzkripció

A promoter által elismert megindítása transzkripciós faktor - a szigma alegysége RNS-polimeráz. Míg Sigma alegység egy komplex egy polimerázzal, megy keresztül a DNS-szekvencia, amíg eléri egy promoter szekvenciát, amely azt leginkább vonatkoznak. Letiltása a iniciációs faktor a promoter történik egyidejűleg a nyúlás a transzkripció.

A promóterek lehetnek különböző „erő promoter”, azaz, hogy kötődik az RNS-polimeráz-komplex változó hatékonyságot. Gyenge promóterek igényel további tényezők transzkripció megindításához. promoter erőssége is függ a szinten DNS szuperspirálosodá bakteriális: jelenlétében negatív csavaró molekula, olvadni kezd, és a transzkripció kezdődik gyorsan.

Eukarióták 3 osztálya RNS-polimeráz, amelyek mindegyike saját promóterek és a transzkripció megindítását mechanizmusokat.

A szerkezet a promoter az RNS-polimeráz-II

Promoterek az RNS polimeráz II rendszerint tartalmaznak három csoportját összetevőből áll: a proximális, disztális és a bazális. Közelebbi régióban található -200 és -50 nukleotidok upstream transzkripciós kezdőpont. Távolabbi bárhol lehet.

Ahhoz, hogy az alap promoter elemek közé tartoznak:

• TATA-box, amely körülbelül -30 nukleotid a kezdetektől
• iniciátor elem - a kezdő-
• downstream elemét (DPE, downstream promoter alkotórészből) - körülbelül 30 bázispár távolságra a start
• GC-box található, amely felett a TATA-box.

Nem minden eukarióta gén ilyen elemeket.

megindítását transzkripció

Eukariótákban, RNS-polimeráz-II, amely felelős a szintézis a legtöbb nem-kódoló RNS-t és mRNS-t egy fehérje komplex 12 alegységből áll. A transzkripció megindításához a promoternek, hogy megfeleljen az előre-iniciációs komplexben 6 alegységek.

A TATA-box asszociált fehérje TBP (Engl. TATA-box kötő fehérje), ami fellazítja DNS helyén a promoter. Ez a fehérje több cofactors megtanulják, hogy más promoterrégiói (downstream elemét, GC-box), hogy egy adott gén TATA-box.